Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q5VSD8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q5VSD8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q5VSD8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q5VSD8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q5VSD8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q5VSD8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Q5VSD8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q5VSD8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Q5VSD8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q5VSD8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Q5VSD8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q5VSD8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q5VSD8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q5VSD8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Q5VSD8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q5VSD8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q5VSD8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q5VSD8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q5VSD8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q5VSD8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q5VSD8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q5VSD8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q5VSD8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Q5VSD8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Q5VSD8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q5VSD8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q5VSD8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q5VSD8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q5VSD8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q5VSD8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q5VSD8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q5VSD8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q5VSD8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q5VSD8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q5VSD8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q5VSD8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q5VSD8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q5VSD8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q5VSD8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q5VSD8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q5VSD8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms