Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms