Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HES3Q5TGS1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms