Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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