Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BEND3Q5T5X7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms