Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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