Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
FRMPD1Q5SYB0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FRMPD1Q5SYB0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms