Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITRM1Q5JRX3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms