Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAN3Q58A45 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms