Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDLIM3Q53GG5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms