Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms