Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms