Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF3Q496Y0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF3Q496Y0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms