Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms