Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD55Q3KP44 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms