Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKOR2Q2VWA4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR2Q2VWA4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms