Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL40Q2TBA0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms