Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TYSND1Q2T9J0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms