Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPHKAPQ2M3C7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPHKAPQ2M3C7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPHKAPQ2M3C7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPHKAPQ2M3C7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPHKAPQ2M3C7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPHKAPQ2M3C7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPHKAPQ2M3C7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPHKAPQ2M3C7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPHKAPQ2M3C7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPHKAPQ2M3C7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPHKAPQ2M3C7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPHKAPQ2M3C7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPHKAPQ2M3C7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPHKAPQ2M3C7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SPHKAPQ2M3C7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms