Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q1T7F1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q1T7F1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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