Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms