Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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