Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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NDUFA9Q16795 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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NDUFA9Q16795 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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NDUFA9Q16795 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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NDUFA9Q16795 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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NDUFA9Q16795 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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NDUFA9Q16795 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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NDUFA9Q16795 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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NDUFA9Q16795 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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NDUFA9Q16795 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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NDUFA9Q16795 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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NDUFA9Q16795 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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