Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
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