Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HIST3H3Q16695 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIST3H3Q16695 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIST3H3Q16695 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIST3H3Q16695 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIST3H3Q16695 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIST3H3Q16695 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HIST3H3Q16695 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HIST3H3Q16695 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIST3H3Q16695 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIST3H3Q16695 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIST3H3Q16695 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIST3H3Q16695 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIST3H3Q16695 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HIST3H3Q16695 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIST3H3Q16695 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIST3H3Q16695 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIST3H3Q16695 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIST3H3Q16695 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIST3H3Q16695 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIST3H3Q16695 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms