Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN3Q16667 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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