Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NFE2Q16621 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms