Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTF1Q16619 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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CTF1Q16619 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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CTF1Q16619 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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CTF1Q16619 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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