Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A3Q16572 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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