Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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TNXAQ16473 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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TNXAQ16473 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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TNXAQ16473 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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TNXAQ16473 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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TNXAQ16473 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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TNXAQ16473 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNXAQ16473 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
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TNXAQ16473 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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TNXAQ16473 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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TNXAQ16473 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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