Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA6Q16445 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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