Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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