Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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SYCP1Q15431 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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