Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms