Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RABEP1Q15276 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
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