Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCF4Q15080 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms