Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KARSQ15046 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KARSQ15046 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KARSQ15046 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KARSQ15046 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KARSQ15046 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KARSQ15046 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KARSQ15046 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KARSQ15046 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KARSQ15046 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KARSQ15046 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KARSQ15046 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KARSQ15046 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KARSQ15046 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KARSQ15046 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KARSQ15046 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KARSQ15046 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KARSQ15046 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KARSQ15046 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KARSQ15046 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KARSQ15046 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KARSQ15046 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KARSQ15046 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KARSQ15046 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KARSQ15046 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KARSQ15046 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KARSQ15046 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KARSQ15046 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KARSQ15046 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KARSQ15046 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KARSQ15046 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KARSQ15046 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KARSQ15046 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KARSQ15046 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KARSQ15046 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KARSQ15046 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KARSQ15046 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KARSQ15046 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KARSQ15046 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KARSQ15046 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KARSQ15046 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KARSQ15046 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KARSQ15046 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KARSQ15046 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KARSQ15046 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KARSQ15046 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KARSQ15046 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KARSQ15046 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KARSQ15046 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KARSQ15046 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KARSQ15046 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KARSQ15046 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KARSQ15046 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KARSQ15046 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KARSQ15046 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KARSQ15046 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KARSQ15046 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KARSQ15046 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KARSQ15046 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KARSQ15046 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KARSQ15046 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KARSQ15046 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KARSQ15046 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KARSQ15046 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KARSQ15046 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KARSQ15046 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KARSQ15046 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KARSQ15046 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KARSQ15046 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KARSQ15046 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KARSQ15046 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KARSQ15046 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KARSQ15046 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KARSQ15046 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KARSQ15046 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KARSQ15046 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KARSQ15046 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KARSQ15046 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KARSQ15046 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KARSQ15046 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KARSQ15046 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KARSQ15046 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KARSQ15046 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KARSQ15046 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KARSQ15046 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KARSQ15046 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KARSQ15046 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KARSQ15046 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KARSQ15046 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KARSQ15046 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KARSQ15046 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KARSQ15046 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KARSQ15046 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KARSQ15046 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KARSQ15046 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KARSQ15046 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KARSQ15046 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KARSQ15046 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KARSQ15046 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KARSQ15046 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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