Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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