Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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