Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP1A4Q13733 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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