Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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CUL3Q13618 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL3Q13618 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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