Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATMQ13315 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATMQ13315 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATMQ13315 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATMQ13315 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATMQ13315 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATMQ13315 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATMQ13315 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATMQ13315 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATMQ13315 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATMQ13315 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATMQ13315 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATMQ13315 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATMQ13315 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATMQ13315 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATMQ13315 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATMQ13315 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATMQ13315 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATMQ13315 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATMQ13315 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATMQ13315 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATMQ13315 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATMQ13315 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATMQ13315 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATMQ13315 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATMQ13315 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATMQ13315 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATMQ13315 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATMQ13315 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATMQ13315 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATMQ13315 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATMQ13315 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATMQ13315 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATMQ13315 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATMQ13315 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATMQ13315 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATMQ13315 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATMQ13315 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATMQ13315 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATMQ13315 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATMQ13315 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATMQ13315 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATMQ13315 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATMQ13315 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATMQ13315 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATMQ13315 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATMQ13315 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATMQ13315 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATMQ13315 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATMQ13315 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATMQ13315 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATMQ13315 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATMQ13315 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATMQ13315 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATMQ13315 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATMQ13315 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATMQ13315 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATMQ13315 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATMQ13315 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATMQ13315 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATMQ13315 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATMQ13315 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATMQ13315 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATMQ13315 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATMQ13315 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATMQ13315 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATMQ13315 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATMQ13315 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATMQ13315 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATMQ13315 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATMQ13315 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATMQ13315 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATMQ13315 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATMQ13315 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATMQ13315 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATMQ13315 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATMQ13315 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATMQ13315 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATMQ13315 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATMQ13315 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATMQ13315 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATMQ13315 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATMQ13315 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATMQ13315 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATMQ13315 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATMQ13315 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATMQ13315 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATMQ13315 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATMQ13315 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATMQ13315 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATMQ13315 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATMQ13315 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATMQ13315 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATMQ13315 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATMQ13315 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATMQ13315 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATMQ13315 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATMQ13315 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
ATMQ13315 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATMQ13315 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
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