Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
GRIN2BQ13224 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
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