Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RESTQ13127 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RESTQ13127 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RESTQ13127 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RESTQ13127 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RESTQ13127 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RESTQ13127 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RESTQ13127 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RESTQ13127 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RESTQ13127 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RESTQ13127 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RESTQ13127 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RESTQ13127 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RESTQ13127 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RESTQ13127 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RESTQ13127 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RESTQ13127 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RESTQ13127 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RESTQ13127 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RESTQ13127 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RESTQ13127 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RESTQ13127 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RESTQ13127 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RESTQ13127 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RESTQ13127 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RESTQ13127 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RESTQ13127 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RESTQ13127 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RESTQ13127 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RESTQ13127 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RESTQ13127 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RESTQ13127 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RESTQ13127 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RESTQ13127 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RESTQ13127 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RESTQ13127 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RESTQ13127 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RESTQ13127 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RESTQ13127 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RESTQ13127 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RESTQ13127 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RESTQ13127 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RESTQ13127 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RESTQ13127 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RESTQ13127 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RESTQ13127 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RESTQ13127 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RESTQ13127 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RESTQ13127 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RESTQ13127 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RESTQ13127 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RESTQ13127 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RESTQ13127 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RESTQ13127 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RESTQ13127 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RESTQ13127 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RESTQ13127 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RESTQ13127 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RESTQ13127 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RESTQ13127 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RESTQ13127 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RESTQ13127 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RESTQ13127 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RESTQ13127 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RESTQ13127 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RESTQ13127 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RESTQ13127 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RESTQ13127 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RESTQ13127 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RESTQ13127 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RESTQ13127 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RESTQ13127 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RESTQ13127 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms