Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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