Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4Q12950 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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