Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms