Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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