Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
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