Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFEMP1Q12805 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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